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研究对报告偶然的基因发现提出了疑问

导读 根据一项研究,对患有与心脏病相关的遗传变异的患者的医疗记录进行审查后发现,患者通常没有任何症状或体征,这对一些被认为与严重疾病相关...

根据一项研究,对患有与心脏病相关的遗传变异的患者的医疗记录进行审查后发现,患者通常没有任何症状或体征,这对一些被认为与严重疾病相关的遗传变异的有效性提出了质疑。JAMA1 月 5 日号。

选定基因集、全外显子组和全基因组的测序越来越多地用于研究和临床护理。这些方法还确定了具有潜在临床相关性的偶然发现(也称为次要发现)。在临床前诊断和风险因素缓解的前景推动下,美国医学遗传学和基因组学学院支持返回医学上可行的偶然发现,并生成了一份基因列表,其中已知或预测致病性(与疾病的遗传原因有关)或应将变异体返回给接受临床测序的患者。这些建议一直存在争议,因为这些变异的临床表现频率及其对诊断和治疗的影响尚不清楚。根据背景,电子病历 (EMR) 中的表型(个体的外观或特征,由个体的基因构成与其环境相互作用产生)数据可以提供评估罕见变异临床相关性的资源。文章中的信息。

田纳西州纳什维尔范德比尔特大学医学中心的 Dan M. Roden 医学博士和 Sara Van Driest 医学博士、哲学博士及其同事根据专家评审确定的具有致病性变异的个体的 EMR 确定了临床表型。心律失常易感基因。该研究纳入了来自 7 个美国学术医疗中心的电子病历和基因组网络药物基因组学项目的 2,022 名非抗心律失常药物暴露表型个体。3 个实验室通过与数据库 ClinVar 进行比较,评估了 SCN5A 和 KCNH2 的变异体(长 QT 和 Brugada 综合征(可能致命的心脏病)的疾病基因)的潜在致病性。相关表型是根据 EMR 确定的,数据从 2002 年(或某些地点更早)到 2014 年 9 月 10 日可用。

在 2,022 名研究参与者中,共鉴定出 223 名个体(占研究队列的 11%)的 2 个心律失常易感基因中存在 122 个罕见变异。专家实验室对这些变异进行了审查,指定 42 种变异具有潜在致病性,但这些分类在各个实验室之间并不一致。对 EMR 和心电图 (ECG) 数据的审查显示,与没有指定变异的参与者相比,具有指定变异的参与者的心律失常诊断或心电图表型患病率没有差异。

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