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研究人员正在开发一种更快的密码破解器来分析人类 DNA

导读 由 Praveen Rao 领导的密苏里大学的研究人员正在开发一种免费的在线资源,该资源可以帮助科学家通过分析人类基因组来加速发现各种人类疾

由 Praveen Rao 领导的密苏里大学的研究人员正在开发一种免费的在线资源,该资源可以帮助科学家通过分析人类基因组来加速发现各种人类疾病,例如镰状细胞病、囊性纤维化甚至 COVID-19比目前可用的方法快三倍。

“每个人的基因组都是不同的,所以我们方法的一个好处是帮助科学家了解一个人的基因组如何以不同的方式使他们易患不同的疾病,”健康管理和信息学副教授 Rao 说,他在该研究所联合任职。电气工程和计算机科学系。“然而,研究人类基因组会产生大量数据,因此在做出科学发现之前,还需要大量的计算能力来分析这些基因组。”

Rao 说,通过加快数据分析过程,他们的资源可以帮助减少相关的时间和金钱成本,从而为科学家提供机会对人类基因组进行更大规模的研究,同时能够快速处理数千个基因组。

“科学家们将能够处理比以前更多的数据,因此他们的数据建模将变得更加准确,”Rao 说。“这种方法还将允许在研究中包含更多的见解,这可以使发现更具普遍性和可扩展性,以大规模生产规模的潜在治疗方法。这项工作也使我们在加快基因组处理管道方面向前迈进了一步,这可以间接影响医疗环境中围绕患者护理的决策和其他事情。”

自 1990 年代初开始人类基因组计划 (HGP) 以来,技术的进步使科学家能够更详细地了解人类“代码”,也称为构成个人“蓝图”的人类基因组或 DNA “为每个人。

Rao 说,这个研究项目的灵感来自其他科学家,他们目前正在研究如何识别与 COVID-19 相关的任何潜在遗传联系。

“我们从 COVID-19 中了解到,我们的 DNA 拥有许多答案——我们是否容易感染它,我们是否住院,我们是否从中康复,甚至我们是否表现出症状,”Rao 说。

在 2021 年 11 月 1 日至 5 日举行的虚拟第 30 届 ACM 国际信息和知识管理会议 (CIKM 2021) 期间,发表了论文“使用商品集群加速人类基因组的变异识别”。提名“最佳短论文奖”。合著者包括 MU 的 Arun Zachariah、Deepthi Rao、Peter Tonellato、Wesley Warren 和 Eduardo Simoes。

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