1、称号的来源不同：皇后是世界历史上帝国最高统治者（皇帝）正配的称号。王后是国王嫡妻之称号，常见于日本以及东南亚地区。
2、唯一性不同：皇后是皇帝的正妻，只有一人。诸侯王正妻称王后，而诸侯王可以有很多。
3、权利不同：皇后在后宫的地位就如同天子，是众妃子之主。皇后在礼仪上与皇帝平等，出同车、入同座。在元旦、皇帝以及本人生日要接受百官的朝贺。皇后拥有自己的官署（如汉朝的皇后三卿），负责管理后宫，理论上皇帝的所有嫔御、后宫的宫女、女官等，都是她的臣属。王后作为诸侯王正妻没有官署。只管理诸侯王的嫔妃。